Значит ситуация такая: в доме фирма установила окна в двух квартирах.
Окна абсолютно одинаковые. (профиль Тиссен-фаворит, окна двухкамерные). Разница одна – у соседей ширина внешней воздушной камеры меньше, чем внутренней, у нас - наоборот. В результате звукоизоляция у нас на порядок хуже, чем у соседей . В связи с этим вопрос: может ли звукоизоляция так сильно зависеть от данного фактора?

нет, от этого шумоизоляция не может зависеть - никак! кстати, как это определялось, разницу я имею в виду, в шумоизоляции? если одни окна во двор выходят, а другие на улицу с оживленной магистралью под окнами, то шумоизоляция будет, несомненно, казаться гораздо хуже..))